下呼吸道感染(LRIs)是致命的感染性疾病之一，数百种病原体（包括细菌、病毒、真菌等）均可以导致肺部感染。由于传统检测方法的限制，很多感染病例无法获得及时、准确的病原学诊断。近年来，基于高通量测序技术的宏基因组学(mNGS)检测方法逐渐从科研走向临床应用，该方法不依赖微生物培养，借助高通量测序平台，一次性对感染样本中微生物的核酸(DNA/RNA)进行测序，获得的序列被比对到微生物数据库，从而确定样本中存在的病原体，已为临床多种疑似感染病例的诊断提供了非常重要的病原学证据。虽然mNGS检测前景广阔，但目前尚缺乏标准化的检测流程（从样本处理、核酸提取、文库构建、测序、生物信息学分析到结果报告），不同实验室间的检测结果可能存在较大差异。为了解国内实验室检测现状及质量状况，国家卫生健康委临床检验中心（以下简称“临检中心”）开展了全国下呼吸道感染宏基因组测序室间质量评价预研活动，要求各实验室使用日常所用试剂和流程进行检测并回报检测结果。

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